- 本會於民國97年1月9日向臺灣士林地方法院聲請辦理社團法人登記。
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- 民國97年1月23日臺灣士林地方法院核發本會社團法人登記證書。
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- 民國97年3月23日，本會監事主席宮南投縣草屯龍德廟主任委員林瑞君率領委員善信共800人，並由陣頭迎請保生大帝聖駕至理事長宮臺北市大龍峒保安宮參香。
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- 民國97年4月11日，本會常務理事宮臺南縣仁德保華宮新廟落成，邀請本會理監事宮及顧問等參加安座大典，參加宮廟有本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮等31家參加盛會。
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- 民國97年4月12日，本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮「2008保生文化祭」開鑼式，由總統當選人馬英九、臺北市長郝龍斌及大龍峒保安宮董事長廖武治共同主持。本會臺南市大觀音亭興濟宮、屏東縣枋寮北勢寮保安宮、臺北縣板橋保安宮、新竹市仙水鎮安宮，臺北縣中和溥濟宮、南投縣埔里天旨宮、宜蘭縣草湖玉尊宮，名譽理事長周尚賢、顧問等前來參加。
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- 民國97年4月15日至17日，廈門青礁慈濟宮舉辦第三屆「保生慈濟文化節」，本會宮廟由理事長廖武治帶領理監事宮廟及顧問等共45人參加，另常務理事宮金門縣烈嶼保生大帝廟有290人參加。17日上午在青礁慈濟宮前廣場舉行開幕式，大陸全國政協副主席林文漪、全國政協常委黄志賢、福建省政協主席梁绮萍、副主席葉家松等人出席。本會理事長廖武治應邀在開幕式致詞，並擔任保生頌典主祭人。會前並至白礁慈濟宮、溫厝慈濟北宮、濠頭社濠沙宮、徐厝社福源宮、薛厝社龍興宮、溪頭下社寶海堂、曾厝垵社福海宮、曾厝垵社擁湖宮等保生大廟廟宇參香。
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- 民國97年4月30日本會出版成立專刊1000冊，分送本會各宮廟。
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- 民國97年5月31日，本會第一屆第二次理監事會議在高雄市前鎮區廣濟宮召開。會中通過本會設信仰文化推廣小組、健康醫療服務小組、刊物編輯小組，以推動本會各種業務，健康醫療服務小組由副理事長臺北縣蘆洲市保和宮主任委員李澄清擔任召集人、刊物編輯小組由副理事長臺南縣學甲慈濟宮董事長吳玉柱擔任召集人、信仰文化推廣小組由副理事長高雄市後勁聖雲宮主任委員葉盈春擔任召集人。
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- 民國97年6月14日，本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮舉辦「2008年道教神祇學術研討會」，本會理監事宮宮廟參加研討會。
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- 民國97年7月4日，本會會員宮澎湖縣湖西鄉南寮保寧宮與廈門青礁慈濟宮，共同舉辦4天3夜「戊子年保生大帝神像巡遊澎湖」活動，在澎湖馬公市區等地巡安遶境。
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- 民國97年8月24日，本會理事長廖武治應大陸國務院臺辦邀請前往北京參加奧運會閉幕式，並於8月22日及23日分別接受全國政協副主席林文漪及全國政協常委汪毅夫晚宴及午餐招待，8月25日上午由國家宗教事務局處長薛樹琪陪同，在國務院臺灣事務辦公室會見常務副主任鄭立中，並就兩岸宗教及文化交流交換意見。
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- 民國97年8月31日，彰化慶安宮千人進香團，恭迎保生大帝聖駕至本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮參香，保安宮亦恭請保生大帝聖駕由楊、李元帥護駕迎接，並作宗教及文化交流。
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- 民國97年9月6日，本會第一屆第三次理監事會議在臺南市海尾朝皇宮舉行。
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- 民國97年9月15日，內政部為獎勵九十六年辦理社會公益慈善及教化事業績優宗教團體，此次獲行政院獎勵的有本會理事宮臺南縣仁壽宮，獲內政部表揚的有本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮、副理事長宮臺南縣學甲慈濟宮、理事宮臺南縣仁壽宮、常務監事宮臺南縣北門三寮灣東隆宮。
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- 民國97年9月20日，本會監事副主席宮臺中市元保宮由副主任委員賴松東率領委員暨眾善信700人進香團，恭迎保生大帝聖駕、神將16尊、陣頭等至本會理事長宮臺北市大龍峒保安宮參香，保安宮亦恭請保生大帝聖駕，由楊、李元帥護駕迎接。
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- 民國97年11月，本會理事長廖武治，應內政部續聘為宗教諮詢委員會委員。
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- 民國97年11月16日，大陸白礁慈濟宮為同謁保生大帝、共續文化情緣，特舉辦「海峽兩岸保生大帝文化節」，邀請本會協辦，並請本會宮廟代表赴白礁慈濟宮參加。另外活動項目中「海峽兩岸保生大帝文化研討會」，本會理事長廖武治率領理監事宮27宮廟代表及信眾一行200多人前往參加。本會理事長廖武治應邀在開幕式致詞，並擔任祭典主祭人。另外，活動項目中「海峽兩岸保生大帝文化研討會」，本會理事長廖武治等四人撰寫相關文章參加。
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- 民國97年11月29日，本會第一副理事宮臺北縣蘆洲保和宮建廟100週年五朝清醮舉行文化祭開鑼式，本會理事長廖武治受邀參加開鑼式並致詞，11月30日遶境踩街大龍峒保安宮保生大帝聖駕由楊、李元帥及內門宋江陣護駕參加遶境出巡，同參醮儀。12月7日醮典圓滿舉行三獻禮及平安宴本會理監事宮計有27家宮廟及顧問參加盛典。
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- 民國97年12月11日，菲律賓馬尼拉寶泉庵正爐新廈落成舉行開光安座大典，邀請海內外同祀宮廟執事共祭保生大帝，晚間舉辦迎賓晚會。參加晚會的貴賓有馬尼拉市長、當地僑領及各界人士，宮廟有來自大陸的代表團白礁慈濟宮、青礁慈濟宮、深滬寶泉庵、香港寶泉庵及來自臺灣的臺灣保生大帝信仰總會代表團，包括理事長宮臺北市大龍峒保安宮、副理事長宮臺北縣蘆洲保和宮、臺南縣學甲慈濟宮、高雄市後勁聖雲宮、監事主席宮南投草屯龍德廟、常務理事宮臺南市興濟宮、常務監事宮臺南縣北門東隆宮、理事宮臺南縣歸仁仁壽宮、名譽理事長周尚賢以及宜蘭草湖玉尊宮，另外來自新加坡的代表團有真人宮、鵬峰宮。
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- 民國97年12月16日，本會常務理事宮高雄市苓雅區鼓山亭修繕完竣舉行慶成謝土法會，晚間舉辦平安宴晚會。參加晚宴有理事長宮臺北市大龍峒保安宮等宮廟。
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- 民國97年12月27日，本會第一屆第二次會員大會由臺北市大龍峒保安宮承辦，臺南縣西港後營普護宮協辦。會中討論大陸廈門青礁慈濟宮有意於明年恭請保生大帝聖駕前來臺灣各地巡安，邀請本會共襄盛舉案，因目前臺灣面臨國際金融海嘯造成經濟不景氣，導致籌措經費不易，經決議俟適當時機再議。
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